Добрый вечер, Елена.
Да, ваш бухгалтер прав.
После снятия с учета нельзя использовать уменьшение налога на исчисленные взносы.
(Статья 346.32 НК РФ. Порядок и сроки уплаты единого налога):
2.1. Указанные в пункте 2 настоящей статьи страховые платежи (взносы) и пособия уменьшают сумму единого налога, исчисленную за налоговый период, в случае их уплаты в пользу работников, занятых в тех сферах деятельности налогоплательщика, по которым уплачивается единый налог.
При этом налогоплательщики (за исключением налогоплательщиков, указанных в абзаце третьем настоящего пункта) вправе уменьшить сумму единого налога на сумму указанных в пункте 2 настоящей статьи расходов не более чем на 50 процентов.
Индивидуальные предприниматели, не производящие выплаты и иные вознаграждения физическим лицам, уменьшают сумму единого налога на уплаченные страховые взносы на обязательное пенсионное страхование и на обязательное медицинское страхование в размере, определенном в соответствии с пунктом 1 статьи 430 настоящего Кодекса.
В вашем случае налог за 2 квартал придется уплатить в полном объеме, поскольку на момент представления декларации у физ. лица уже нет статуса ИП.
