Здравствуйте! К сожалению, РВП в вашем случае жене должно быть выдано именно в том регионе, в котором Вы, как ее супруг, зарегистрированы по месту жительства. Так, согласно пп.4 п.3 ст.6 Федерального закона от 25.07.2002 N 115-ФЗ «О правовом положении иностранных граждан в Российской Федерации»:
3. Без учета утвержденной Правительством Российской Федерации квоты разрешение на временное проживание может быть выдано иностранному гражданину:
4) состоящему в браке с гражданином Российской Федерации, имеющим место жительства в Российской Федерации, — в субъекте Российской Федерации, в котором расположено место жительства гражданина Российской Федерации, являющегося его супругом (супругой);
До 2019 года выдача РВП жене по месту Вашего пребывания была бы вполне возможна, т.к. предыдущая редакция вышеуказанного закона позволяла это сделать:
4) состоящему в браке с гражданином Российской Федерации, имеющим место жительства в Российской Федерации;