Как правильно написать поручение между организациями о содержании здания

Сергей!

Гражданский Кодекс РФ допускает использование различных форм исполнения обязательств арендатора по внесению арендной платы:

Статья 614. Арендная плата
 
1. Арендатор обязан своевременно вносить плату за пользование имуществом (арендную плату).

Порядок, условия и сроки внесения арендной платы определяются договором аренды. В случае, когда договором они не определены, считается, что установлены порядок, условия и сроки, обычно применяемые при аренде аналогичного имущества при сравнимых обстоятельствах.
2. Арендная плата устанавливается за все арендуемое имущество в целом или отдельно по каждой из его составных частей в виде:
1) определенных в твердой сумме платежей, вносимых периодически или единовременно;
2) установленной доли полученных в результате использования арендованного имущества продукции, плодов или доходов;
3) предоставления арендатором определенных услуг;
4) передачи арендатором арендодателю обусловленной договором вещи в собственность или в аренду;
5) возложения на арендатора обусловленных договором затрат на улучшение арендованного имущества.
Стороны могут предусматривать в договоре аренды сочетание указанных форм арендной платы или иные формы оплаты аренды.

Ни вижу ничего страшного в том, чтобы вы в счёт уплаты арендной платы производили внесение платежей за арендодателя на счёт коммунальных организаций, тем боле, что в расчёт арендной платы эти самые коммунальные услуги входят. Предложенный вам вариант поручения на перечисление денег коммунальщикам вполне вписывается в такую схему расчётов и может быть применим в данной ситуации.

Что касается других платежей, указанных Вами, то схема вполне может быть такой же, арендодатель может предложить вам оплачивать дополнительные услуги также в счёт арендной платы. Другое дело, если эти услуги продолжает оказывать сам арендодатель, но тогда он должен понимать, что реальных денег за эти работы при долге у приставов он не получит.