Здравствуйте, Светлана.
В соответствии с Приказом Следственного комитета РФ от 15.01.2011 N 4 «Об установлении юрисдикции специализированных следственных органов Следственного комитета Российской Федерации» утвержден "ПЕРЕЧЕНЬ ТЕРРИТОРИЙ, НА КОТОРЫЕ РАСПРОСТРАНЯЕТСЯ ЮРИСДИКЦИЯ СПЕЦИАЛИЗИРОВАННЫХ СЛЕДСТВЕННЫХ ОРГАНОВ НА ТРАНСПОРТЕ СЛЕДСТВЕННОГО КОМИТЕТА РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ". В соответствии с приказом, в пределах территории Ростовской области распространяется юрисдикция Южного СУТ СК России:
4. Южное следственное управление на транспорте Следственного комитета Российской Федерации (Южное СУТ СК России):
в пределах территорий Республики Дагестан, Республики Калмыкия, Краснодарского края, Астраханской и Ростовской областей
Два дела тут не может быть. Скорее всего, в рамках одного происшествия по какому-то факту есть компетенция СК на транспорте, а по другому факту компетенция районного СК. За разъяснением ситуации нужно обращаться к должностному лицу, проводящему проверку по факту происшествия.
Надеюсь, что помог в разрешении вопроса. Удачи Вам.