Сергей, здравствуйте!
Согласно ст. 2 Федерального закона «Об ипотеке (залоге недвижимости)» от 16.07.1998 N 102-ФЗ ипотека может быть установлена в обеспечение обязательства по кредитному договору, по договору займа или иного обязательства, в том числе обязательства, основанного на купле-продаже.
При оформлении кредитного договора на покупку жилья заемщик должен предоставить в банк не только сам договор купли-продажи объекта недвижимости, но и все документы по приобретаемому объекту недвижимости, а также дополнительные документы, необходимые согласно требованиям законодательства.
Что касается первоначального взноса (собственных средств заемщика), то это по соглашению между продавцом и покупателем. Как договоритесь. Можно просто показать банку выписку из банковского счета, где будет видно наличие собственных средств — и тогда продавец получит все деньги сразу после регистрации в Росреестре. А можно передать продавцу аванс и показать кредитору расписку.
Здесь работает принцип свободы договора.
Всего доброго!