Добрый день!
Ситуация, конечно, как Вы описываете, не совсем понятна. Почему военкомат идет на явное нарушение Закона.
В любом случае Вы вправе ознакомиться с заключением о годности к военной службе, с медицинским заключением о состоянии здоровья, которые должны находится в личном деле призывника.
Для этого нужно написать письменное заявление военному комиссару о желании ознакомиться с личным делом и снять копии соответствующих документов. Это можете сделать либо Вы самостоятельно либо Ваш представитель.
После ознакомления с личным делом и нужно принимать решение об обжаловании решения призывной комиссии, либо требовать повторного обследования.