Каким образом можно минимизировать штраф и/или пени?

Здравствуйте, Семен!

Чтобы сказать, как минимизировать налог нужно, прежде всего, разбираться как он у вас возник, исходя из каких операций и каких начислений.

Если вы ранее бросали ООО, то что вам сейчас мешает использовать такую «профилактику»?

1. писать Ходатайство в налоговую виноват, кризис, двое маленьких детей + переезд в пригород в тот период (есть документы) + смена бухгалтера итд и тп

Нет. Ваши личные обстоятельства никак не могут повлиять на исполнение обязанностей по налогообложению ООО. Это можно было бы использовать, если бы вы были ИП. А в данном случае не получится.

2. Предупреждение вместо штрафа… действует ли для налогов

За административное правонарушение может, но не за налоговое.

3. платить маленькими частями как то фиксировать сумму в налоговой

Можно. Но налоговый орган имеет все основания, например, заблокировать вам расчетный счет, что поставит под вопрос вашу деятельность.

4. Банкротится все продавать физ лицу (учредитель он же директор и бухгалтер (официально) 1 лицо) чтоб нечего было взять ..

5. Заплатить и закрыться 4 человека без работы…

Это все возможные варианты, но не безопасные. Налоговая может отследить все эти сделки и взыскать недоимку с взаимозависимых лиц.

Здравствуйте. Ситуация неприятная и если пользоваться п.4, то последствия могут быть не слишком хорошими, коллега Унароков уже описал.

Возможно есть смысл подумать вот о чем. Если при единовременной уплате налога или взносов могут возникнуть признаки банкротства, Вы можете обратиться за отсрочкой/рассрочкой уплаты налога.

Об этом можно почитать вот тут:

glavkniga.ru/situations/118560

Базируется на

НК РФ Статья 64. Порядок и условия предоставления отсрочки или рассрочки по уплате налога, сбора, страховых взносов

Дело это не слишком простое, но в Вашей ситуации может помочь.

во втором квартале 2016 года была сдана декларация на сумму около 400000 НДС к уплате (подставила новый бухгалтер)

Семен

Семен, здравствуйте, не очень понятно — сумма к уплате завышена, декларация с ошибкой? Тогда надо подать уточненную, сумма уменьшится.

Только учтите, что налоговая сразу проведет камеральную проверку, запросит, почему налог к уплате уменьшился. Поэтому документы должны быть идеальные

Если часть документов потеряна, то можно запросить дубликаты у контрагентов.

НДС до сих пор не уплачен штрафы + пени уже набежало 600000

Семен

это тоже не очень понятно. откуда такая сумма? даже если налог 400 000, то меньше чем за год какие штрафы и пени на 200 000, за что штраф? 

Совет тут может быть только один — найти грамотного бухгалтера, разобраться с декларацией, разобраться с начислениями. И после этого искать варианты.

Вполне возможно, что там просто ошибки, которые надо исправить.

А варианты с ходатайствами, предупреждениями и прочим не пройдут. И вариант с рассрочкой-отсрочкой, думаю, тоже. Тем более что пени все равно надо будет платить, и налог, конечно, тоже. 

сдаются нулевые отчеты деятельность по этой ООО не ведется

Семен

все продавать физ лицу (учредитель он же директор и бухгалтер (официально) 1 лицо) чтоб нечего было взять ..

Семен

то есть год деятельности не ведете, но имущество есть? или ведете деятельность, но не отражаете?

Хочу Вам сказать, что налоговые органы анализируют деятельность компаний, оценивают определённые показатели, и поэтому проверка может быть если отчетность нулевая, но деятельность ведется.