Здравствуйте.
Вам нужно подать декларацию до 30 апреля 2018 г. и воспользоваться либо вычетом в 1 млн. рублей, с разницы заплатив 13% НДФЛ, или заменить вычет на уменьшение доходов на расходы, связанные с покупкой.
НК РФ Статья 220. Имущественные налоговые вычеты
2) вместо получения имущественного налогового вычета в соответствии с подпунктом 1 настоящего пункта налогоплательщик вправе уменьшить сумму своих облагаемых налогом доходов на сумму фактически произведенных им и документально подтвержденных расходов, связанных с приобретением этого имущества.
В вашем случае второй вариант выгоднее. Вам нужно будет к декларации приложить копии документов, подтверждающие размер ваших расходов на приобретение данной квартиры по ДДУ, документы, подтверждающие уплату денежной суммы. Если доход будет равен расходу, к уплате получите 0 НДФЛ.