Решение о применении каких-либо технических средств в ходе следственных действий принимается следователем, потерпевшему такое право не предоставлено. То есть, если Вы объявите об это следователю, то он вполне законно может потребовать от Вас прекратить запись в ходе следственного действия.
Если следователь не хочет вносить Ваши слова в протокол, Вы не должны подписывать протокол в такой редакции. Либо нужно указать в конце протокола, что с редакцией не согласны, сказанное Вами отражено в нем не верно, можно даже самому дописать недостающие факты.
С другой стороны, если Вы будете неофициально вести запись вашего общения со следователем, это может Вам помочь в случае обжалования его действий, либо доказывания факта совершения им должностного преступления. Также на действия следователя Вы можете жаловаться, указывая на то, каким образом он нарушил Ваши права.