Можно ли вернуть деньги, если оплатили госпошлину за гражданство, а нам отказали?

Да, можно

В соответствие с Статьей 333.40 НК РФ Основания и порядок возврата или зачета государственной пошлины: «Уплаченная государственная пошлина подлежит возврату частично или полностью в случае:»возвращения заявления, жалобы или иного обращения или отказа в их принятии судами либо отказа в совершении нотариальных действий уполномоченными на то органами и (или) должностными лицами. Если государственная пошлина не возвращена, ее сумма засчитывается в счет уплаты государственной пошлины при повторном предъявлении иска, административного иска, если не истек трехгодичный срок со дня вынесения предыдущего решения и к повторному иску, административному иску приложен первоначальный документ об уплате государственной пошлины".

" Заявление о возврате излишне уплаченной (взысканной) суммы государственной пошлины подается плательщиком государственной пошлины в орган (должностному лицу), уполномоченный совершать юридически значимые действия, за которые уплачена (взыскана) государственная пошлина."