Наталья, добрый день!
Насколько я понял из вопроса, квартиру вы уже купили. Если так, то в Вашей ситуации целесообразно запросить в Ростехинвентаризации (БТИ) копию технического паспорта на квартиру на дату последней инвентаризации. Далее возможны варианты.
Если экспликация в тех.паспорте соответствует фактической планировке квартиры, т.е. по данным БТИ квартира именно трехкомнатная, то необходимо обращаться в органы государственного кадастрового учета (ФКП «Росреестра») с заявлением об исправлении ошибок в государственном кадастре недвижимости (ГКН). Впоследствии, на основании изменений в ГКН, будут внесены изменения и в ЕГРП, т.е. можно будет запросить новое свидетельство с уточненными данными по квартире.
Если экспликация в тех.паспорте не соответствует фактической планировке квартиры, т.е. проводилась перепланировка/переустройство помещения без согласования с муниципальными органами и БТИ (присоединяли колясочную), либо по иной причине (в БТИ просто нет свежих данных, хотя всё было согласовано), понадобится делать технический план помещения (можно в БТИ, можно у других кадастровых инженеров) и на его основе вносить изменения в ГКН.
Если в БТИ вообще нет данных по вашей квартире — понадобится изготавливать в БТИ новый тех.паспорт с выездом техников на место.
Чтобы избежать подобных ситуаций, целесообразно до даты покупки квартиры просить у собственника свежую копию технического паспорта на дату последней инвентаризации и проверять на соответствие фактическую планировку квартиры.