Здравствуйте.
При получении квартиры в наследство срок владения исчисляется со дня смерти наследодателя, а не с даты регистрации права собственности. Таким образом если установленный срок владения (3 года) прошел или пройдет к моменту продажи (регистрации права собственности на нового собственника), то подоходный налог вам платить не требуется.
Если квартира будет продана ранее установленного срока (3 года), то возникает обязанность уплаты подоходного налога. В вашем случае для расчета налога будет иметь значение стоимость в договоре купли-продажи, а не кадастровая стоимость, поскольку для вас действуют прежние правила. Налогооблагаемую базу вы сможете уменьшить на имущественный налоговый вычет 1 млн.р. Налог (13%) будет рассчитывается с разницы между стоимостью продажи и налоговым вычетом 1 млн.р.
(стоимость продажи — 1млн.р.) х 13% = сумма налога к уплате