Добрый день, Оксана!
Из данных указанных в тексте Вашего вопроса можно рассчитать только количество дней просрочки выполнения работ и стоимость работ на которую начисляется неустойка.
Из текста вопроса не понятен конкретный порядок расчета неустойки, предусмотренный договором. И в целом не понятно был ли договор на выполнение работ, было ли в нем условие о неустойке и т. п.
Чтобы определить точную сумму, которую Вы можете требовать, желательно, чтобы Вы процитировали условие договора о неустоке. А в идеале направили полный текст договора и акты, подтверждающие сдачу работ.
Если исходить из имеющейся информации, то неустойка рассчитывается следующим образом:
1. За период с 14.10.2015 по 20.10.2015
Стоимость невыполненных работ (681979,38 руб. ) умножить на процент неустойки, затем умножить на количество дней просрочки (6 дней)
2. За период с 20.10.2015 по 13.11.2015
Стоимость невыполненных работ (94546,79 руб. ) умножить на процент неустойки, затем умножить на количество дней просрочки (24 дня)
Для определения общего размера неустойки суммы полученные в пунктах 1 и 2 надо сложить