Уважаемый Александр!
В силу ст. 81 Трудового кодекса РФ под прогулом понимается — отсутствие на рабочем месте без уважительных причин в течение всего рабочего дня (смены), независимо от его (ее) продолжительности, а также в случае отсутствия на рабочем месте без уважительных причин более четырех часов подряд в течение рабочего дня (смены).
Вас же отстранили от работы, что верно по смыслу ст. 76 Трудового кодекса РФ — Работодатель обязан отстранить от работы (не допускать к работе) работника: не прошедшего в установленном порядке обязательный медицинский осмотр, а также обязательное психиатрическое освидетельствование в случаях, предусмотренных настоящим Кодексом, другими федеральными законами и иными нормативными правовыми актами Российской Федерации; работодатель отстраняет от работы (не допускает к работе) работника на весь период времени до устранения обстоятельств, явившихся основанием для отстранения от работы или недопущения к работе, если иное не предусмотрено настоящим Кодексом, другими федеральными законами.
Таким образом вас не могут уволить с работы за прогул.
При этом, если работодатель захочет вас уволить и затребует объяснительную, вам нужно в ней указать что вы проходили медкомиссию, указать причины по которым вы прошли ее не за 2 дня, а за неделю. Если работодатель посмеет вас уволить и в этом случае — обращайтесь в суд с иском о восстановлении на работе, инспекция по труду при увольнении не поможет.
Удачи вам!