Уважаемый Виктор!
1. Жалоба на действия (бездействия) следователя, дознавателя подается в порядке предусмотренном ст. 124-125 Уголовно-процессуального кодекса РФ.
2. Значение имеет в каком помещении производился обыск. Если в жилом помещении то для такого обыска необходимо постановление суда (за исключением случаев когда обыск не терпит отлагательств, в таком случае суд должен в любом случае проверить законность обыска и вынести соответствующее постановление). Если обыск проводится не в жилом помещении, то для такого обыска достаточно постановления следователя (дознавателя). Жалобу Вы можете подать руководителю следственного органа, прокурору либо обжаловать действия в суд.
3. Обыск в помещении должен был проводится в присутствии представителя организации, с участием понятых. В ходе проведения обыска должен был составляться протокол, копия которого должна была быть передана представителю организации.
На Ваш вопрос отвечал адвокат Спиридонов Михаил Владимирович (г. Новосибирск).