Добрый день!
В соответствии с ФЗ «Об образовании в РФ» (Статья 61. Прекращение образовательных отношений)
1. Образовательные отношения прекращаются в связи с отчислением обучающегося из организации, осуществляющей образовательную деятельность:
1) в связи с получением образования (завершением обучения);
2) досрочно по основаниям, установленным частью 2 настоящей статьи.
2. Образовательные отношения могут быть прекращены досрочно в
следующих случаях, в том числе, по обстоятельствам, не зависящим от воли обучающегося и организации, осуществляющей образовательную деятельность, в том числе в случае ликвидации организации, осуществляющей образовательную деятельность.
Основанием для прекращения образовательных отношений является распорядительный акт организации, осуществляющей образовательную деятельность, об отчислении обучающегося из этой организации.
Таким образом, обучающийся, призванный в ряды Вооруженных Сил РФ, должен быть отчислен в соответствии с п. 2 ст. 61 закона.
Удачи Вам!