Здравствуйте, Марго.
К сожалению, Ваш работодатель прав, так как ВНЖ Вы получили только в 2014 году, то до этого момента на Вас не начислялись стрховые взносы в ФСС.
На сайте ФСС есть разъяснения по ВАшему вопросу:
Облагаются ли страховыми взносами на обязательное социальное страхование на случай временной нетрудоспособности и в связи с материнством выплаты, производимые в пользу работника, являющегося гражданином Республики Беларусь, не имеющего вида на жительство или разрешения на временное проживание на территории Российской Федерации?
Согласно части 4 статьи 1 Федерального закона от 24.07.2009 № 212-ФЗ «О страховых взносах в Пенсионный фонд Российской Федерации, Фонд социального страхования Российской Федерации, Федеральный фонд обязательного медицинского страхования и территориальные фонды обязательного медицинского страхования» (Закон № 212-ФЗ) в случаях, если международным договором установлены иные правила, чем предусмотрены данным Федеральным законом, применяются правила международного договора.
Сотрудничество между Российской Федерацией и Республикой Беларусь в области социального обеспечения установлено Договором от 27.01.2006. При этом положения вышеуказанного Договора распространяются только на граждан Республикой Беларусь, постоянно или временно проживающих на законных основаниях на территории Российской Федерации.
Согласно пункту 15 части 1 статьи 9 Закона № 212-ФЗ на суммы выплат и иных вознаграждений по трудовым договорам и гражданско-правовым договорам, в том числе по договорам авторского заказа в пользу иностранных граждан и лиц без гражданства, временно пребывающих на территории Российской Федерации, страховые взносы не начисляются.
Таким образом, если граждане Республики Беларусь работают в организации по трудовому договору и не имеют вида на жительство или разрешения на временное проживание, они относятся к лицам, временно пребывающим в Российской Федерации, в связи с чем суммы производимых им выплат по трудовым договорам не подлежат включению в базу для начисления страховых взносов на обязательное социальное страхование на случай временной нетрудоспособности и в связи с материнством на основании пункта 15 части 1 статьи 9 Закона № 212-ФЗ.
fss.ru/ru/consultation/29828/31831.shtml