Куда жаловаться, если не снимают с учета после отбытия наказания 3 года?

Андрей, здравствуйте.

Здесь сначала нужно уточнить, о каком именно учёте идёт речь. Сам факт того, что Вы полностью отбыли 3 года лишения свободы, не означает автоматического снятия со всех видов учёта. Например, судимость сохраняется после освобождения в течение срока, установленного ст. 86 УК РФ, в зависимости от категории преступления.

Если речь идёт об административном надзоре МВД, порядок регулируется Федеральным законом № 64-ФЗ. Согласно ст. 9 Закона № 64-ФЗ, надзор прекращается, в частности, по истечении установленного срока, а после его прекращения лицо снимается с соответствующего учёта в органах внутренних дел. 

Если установленный судом срок надзора ещё продолжается, в ряде случаев возможно обратиться в суд с заявлением о досрочном прекращении административного надзора после истечения не менее половины его срока, если ограничения соблюдались и имеются положительные характеристики. Это прямо предусмотрено ч. 2 ст. 9 Закона № 64-ФЗ. 

Поэтому нужно посмотреть документ, на основании которого Вас поставили на учёт: какой именно это учёт, каким органом и на какой срок. После этого можно точно определить, должны ли Вас уже снять и куда подавать жалобу.

Буду признателен за честный отзыв о моём ответе.