Константин, здравствуйте.
Интересует вопрос, что будет в период с сентября по декабрь в случае, если я не смогу поступить на магистратуру?
Вас могут призвать на военную службу на общих основаниях.
В указанный период у Вас не будет отсрочки, что является основанием для призыва.
Решение о предоставлении IT отсрочки осуществляется на основании списков Минцифры.
В силу постановления Правительства РФ от 28.03.2022 N 490 «Об утверждении Правил предоставления права на получение отсрочки от призыва на военную службу гражданам Российской Федерации, работающим в аккредитованных организациях, осуществляющих деятельность в области информационных технологий»
4. Отсрочка от призыва на военную службу предоставляется гражданам призывными комиссиями на основании списка граждан.
Соответственно до того момента, пока Вы не будете включены в указанные списки. а иные основания для предоставления отсрочки (по учебе) у Вас отсутствуют — то Вас могут призвать на военную службу.