Ответ зависит от того, какую именно выплату вы называете денежным довольствием: начисления самого военнослужащего за период безвестного отсутствия или отдельную выплату членам семьи.
Вы указали, что сын пропал без вести и вы единственный родственник, но не написали, какая сумма оформляется и кем. У текущего довольствия, страховых сумм, специальных выплат и денег после установления гибели разный круг получателей. Поэтому один факт лишения родительских прав не позволяет одинаково решить вопрос по всем этим выплатам.
Запросите у воинской части или органа, назначающего выплату, её точное наименование, нормативное основание и письменный перечень получателей. По этому документу можно проверить, перечисляется ли сумма на счёт сына либо семье и исключён ли из её получателей лишённый прав родитель.