Здравствуйте.
Право на выплату у Вас есть - по закону родители погибшего военнослужащего получают положенные выплаты в равных долях, независимо от того, кто фактически проживал с ребенком, если родитель не был лишен родительских прав (ч. 11 ст. 3 ФЗ № 306-ФЗ). А тот факт, что Вы 18 лет исправно платили алименты - это прямое и документально подтвержденное доказательство исполнения родительских обязанностей, что закрывает мамину возможную попытку признать Вас "недостойным" родителем.
Здесь важен нюанс: сам факт, что мать не пускала Вас к сыну, это её противодействие, а не Ваше уклонение. Суды и Верховный Суд в разъяснениях по таким делам (Постановление Пленума ВС РФ № 44) прямо связывают утрату прав на выплаты именно с лишением родительских прав или доказанным злостным уклонением от содержания - а не с тем, что второй родитель препятствовал общению. У Вас же ситуация обратная: обязанность содержания исполнялась в полном объеме, лишения прав не было.
Но на практике часто возникает сложность технического характера: воинская часть или страховая компания при оформлении выплат могут запросить у матери информацию об участии в воспитании, и если она попытается заявить, что Вы "не общались с сыном по своей вине", это может затянуть или осложнить получение доли. Тут важно правильно и быстро подать документы и, если нужно, подготовиться к тому, что мать оспорит Вашу долю.