Вопрос обязаны ли они исключить каникулы летние с договора, так как мусора будет намного меньше чем в учебный период?

Здравствуйте.

Каникулы автоматически исключать не обязаны, потому что плата считается по утвержденному нормативу на 1 обучающегося (или иную расчетную единицу) в месяц, а норматив — годовой, поделенный на 12, а не «по факту мусора». Но у учреждения есть возможности для изменения условий договора и (или) перехода на иной порядок расчета, если это допускается региональными актами.

Как обычно считается плата для школы
Во многих регионах для образовательных организаций расчетной единицей является 1 обучающийся; стоимость услуги в месяц определяется по формуле: общая площадь или число обучающихся × норматив / 12 × единый тариф оператора.
Норматив накопления ТКО устанавливает регион (правительство субъекта РФ) и он уже учитывает годовой режим работы категории потребителя; оператор не придумывает его сам и не обязан вычитать лето, если норматив так не устроен.
Типовые договоры с региональными операторами предусматривают, что расчетный период — календарный месяц, а оплата идет исходя из утвержденного тарифа и объема по нормативу, а не по фактическим мешкам мусора.
Можно ли уменьшить оплату на лето
Федеральные правила допускают два подхода: по нормативу (основной) либо по данным коммерческого учета объема/массы отходов, если есть оборудованные контейнерные площадки, учет массы и соответствующие региональные решения.
В отдельных регионах орган власти может утвердить специальные коэффициенты, методы или отдельные нормативы для разных категорий потребителей (в т. ч. с учетом сезонности), но это нужно смотреть именно в ваших областных/региональных актах по нормативам ТКО и методике расчета.
Если норматив в Московской области не содержит сезонных понижений для школ, то «по умолчанию» оператор не обязан уменьшать объем на период каникул; можно только договариваться об изменении договора (например, переход на расчет по фактическому объему, если регион это разрешает).
Что практически может сделать школа
Запросить у регионального оператора и (или) профильного министерства области:

копию нормативов накопления ТКО для образовательных учреждений;
методику расчета (как именно получено число «на одного обучающегося»).
Письменно предложить оператору:

либо установить расчет по фактическому объему (контейнеры × вывоз × объем), если для этого есть техническая возможность и региональные правила;
либо применять понижающий коэффициент или иной подход на период, когда обучающиеся фактически отсутствуют, со ссылкой на региональные акты, если в них это предусмотрено.
При отказе — обжаловать условия договора или размер начислений в региональную службу по тарифам/ЖКХ, министерство экологии (природопользования) области или в суд, ссылаясь на несоответствие региональным нормам, если такое есть.
Буду признательна за положительный отзыв.