Можно ли включить в одно ходатайство в суд назначение двух разных по типу экспертиз?

Для того, чтобы подать ходатайство о назначении экспертизы Вам необходимо: обосновать необходимость проведения  экспертизы, сформулировать вопросы к эксперту, предложить на выбор несколько экспертных организаций, которым суд может поручить проведение экспертизы. Иногда судьи требуют чтобы при рассмотрении ходатайства о проведении экспертизы сторона, заявившая экспертизу перевела на депозит суда денежную сумму из которой будет проводится её оплата (при решении в пользу лица, заказавшего экспертизу сумма возмещается с другой стороны). Таков набор обязательных требований. На практике суды могут упростить процедуру назначения экспертизы (например, назначить экспертную организацию без предъявления коммерческих предложений от экспертных организаций, предоставляемых стороной процесса и т.п.).

В соответствии с п. 1 ст. 59 ГПК РФ при возникновении в процессе рассмотрения дела вопросов, требующих специальных знаний в различных областях науки, техники, искусства, ремесла, суд назначает экспертизу. Проведение экспертизы может быть поручено судебно-экспертному учреждению, конкретному эксперту или нескольким экспертам.

Однозначного ответа на вопрос сколько предъявлять ходатайств при назначении нескольких экспертиз законодательство не дает. Даже если Вы составите одно ходатайство для проведения всех экспертиз, то суд не лишен возможности удовлетворить его частично — назначить одну экспертизу во второй отказать. 

На мой взгляд удобнее сделать отдельное ходатайство для санитарно-эпидемиологической экспертизы и отдельное для комиссионной детско-родительской, поскольку они будут поручены разным экспертам у каждого будет свой отдельный предмет и метод  исследования и каждому эксперту предоставлен отдельный набор вопросов на разрешение.