149 НК РФ, если он реализует туристский продукт от своего имени, включающий услуги размещения и перевозки, даже если отдельные услуги приобретаются по агентским договорам?

Здравствуйте, Сергей. Вся туроператорская деятельность строго регламентируется Федеральным законом «Об основах туристкой деятельности». 
По поводу первого вопроса — нет, согласно разъяснениям Минфина России, туроператор не может применять освобождение от НДС, предусмотренное подпунктом 39 пункта 3 статьи 149 Налогового кодекса РФ, если выручкой от реализации турпродукта являются суммы вознаграждения, получаемые организацией на основании агентских договоров с третьими лицами, предоставляющими услуги размещения и перевозки. Это связано с тем, что в таком случае организация ведёт предпринимательскую деятельность в интересах другого лица на основе агентских договоров (т. е. является посредником), которая не освобождается от НДС по пункту 7 статьи 149 НК РФ. С вознаграждения по агентским договорам туроператор исчисляет и платит НДС в общем порядке с применением ставки 20%. 
Ответ на второй вопрос: форма договоров с исполнителями не имеет значения, так как льгота применяется именно к пакету услуг, а не к отдельным операциям.
Согласно Федеральному закону от 28.11.2025 №425-ФЗ, освобождение от НДС для туроператоров, работающих во внутреннем и въездном туризме, действует до 31 декабря 2030 года включительно.

Если вам была полезна информация можете отблагодарить символично в профиле.
Если нужна более подробная консультация — можете написать мне лично в чат. 
С уважением, юрист Абдулкадиров Расул Русланович !