Прокурор ответит, что я теперь должна подать на фонд капремота в суд

Если внесудебное банкротство через МФЦ завершено, вы освобождаетесь от требований кредиторов, включённых в заявление/публикацию, за исключением специальных случаев; это прямо установлено ст. 223.6 Закона о банкротстве, при этом исключения от освобождения берутся из ст. 213.28 (п. 4–6) — взносы на капремонт в этот перечень не входят, если требование было заявлено и не является текущим. 
При отказе регионального оператора целесообразно подать в районный суд иск о признании обязательства прекращённым и об обязании прекратить начисления/взыскание долга (как следствие освобождения по ст. 223.6), приложив публикацию на Федресурсе и переписку с фондом. 
Госпошлина по такому иску (неимущественное требование) для физлица составляет 3000 руб. по подп. 3 п. 1 ст. 333.19 НК РФ (действующая редакция). 
Если параллельно велось исполнительное производство, подайте приставу заявление об окончании/прекращении взыскания в связи с освобождением от долгов и верните незаконно удержанные после даты завершения процедуры суммы. Основание освобождения подтверждайте копией уведомления МФЦ о завершении и публикацией на Федресурсе.