Добрый день, Константин!
Надо смотреть ваши ЛНА (обязал ли всех работников работодатель на переход на электронный документооборот).
Оформление заявления на бумажном носителе возможно, если данную ситуацию можно отнести к исключительным случаям оформления документов на бумажном носителе, которые могут быть предусмотрены в локальном нормативном акте, в соответствии с которым в организации был введен кадровый электронный документооборот.
Если такая ситуация не подпадает под эти исключительные случаи, либо они вовсе не предусмотрены ЛНА, оформление работодателем кадрового мероприятия в электронном виде на основании заявления работника, оформленного в нарушение положений ЛНА на бумажном носителе, может повлечь за собой негативные последствия.