Переоформят ли в ГИБДД авто на меня на основании решения суда?

Добрый день!

Наличие судебного решения в вашу пользу — основание для перехода права (если решение вступило в законную силу и исполнено либо подлежит исполнению). 
Практически ГИБДД снимает запрет только после того, как запрет отменён судебным приставом или вступил в силу судебный акт, освобождающий имущество от ареста и/или обязывающий пристава выдать постановление об отмене запрета.

Получите у суда исполнительный лист на основании решения (если он ещё не получен).
Представьте исполнительный лист в подразделение ФССП, которое ведёт исполнительное производство; потребуйте исполнения решения — передачи автомобиля вам (если изъятие/передача предусмотрены решением) и отмены запрета на регистрационные действия. Попросите выдать письменное постановление об отмене запрета (или выписку из реестра запретов).
С постановлением об отмене запрета (или с документами об окончании/исполнении ИП) и с решением/исполнительным листом идёте в ГИБДД — ставят автомобиль на учёт/оформляют переход права на вас.