Здравствуйте,
Да, оплачивает льготный утильсбор.
Коммерческий утильсбор уплачивается в силу Постановления Правительства РФ от 26 декабря 2013 г. N 1291 «Об утилизационном сборе в отношении колесных транспортных средств (шасси) и прицепов к ним и о внесении изменений в некоторые акты Правительства Российской Федерации»
В отношении транспортного средства, ввезенного для личного пользования в Российскую Федерацию до истечения 12 месяцев с даты оформления таможенного приходного ордера в отношении иного транспортного средства, ранее ввезенного для личного пользования...
А вот Вы бы, если бы ввезти сейчас второе ТС ранее 12 месяцев с момента оформоения ТПО за предыдущий ТС, оплачивали коммерческий утиль.