Могу ли я подать заявление онлайн в полицию на должника на основании переписки в WhatsApp, где должник подтверждает сумму остатка долга, но так и не возвращает?

Здравствуйте, Алексей! Это не повод для заявления в полицию, а скорее повод для подачи искового заявления в суд (ст.131-132 ГПК РФ), где переписка из WhatsApp будет доказательством по делу (ст.55-56 ГПК РФ). Согласно части 1 статьи 56 ГПК РФ:

каждая сторона должна доказать те обстоятельства, на которые она ссылается как на основания своих требований и возражений, если иное не предусмотрено федеральным законом.

Ведь согласно пункту 1 статьи 162 ГК РФ:

Несоблюдение простой письменной формы сделки лишает стороны права в случае спора ссылаться в подтверждение сделки и ее условий на свидетельские показания, но не лишает их права приводить письменные и другие доказательства.

Иными словами Вы вправе доказывать факт сделки письменными и другими доказательствами, в т.ч. перепиской.

P.S. Если потребуется консультация, анализ или подготовка документов, ссылка на мой профиль: https://pravoved.ru/lawyer/4041300/