Здравствуйте.
Вам надо консультироваться с юристами из Армении, тут юристы из РФ дают консультации по законодательству РФ.
Если в Армении миграционное законодательство аналогично российскому, то Вы не сможете выехать из Армении не по тому документу, по которому въезжали (кроме случая утраты документа на территории Армении, тогда возвращаться надо по свидетельству о возвращении на родину). То есть если Вы въедете по внутреннему паспорту, Вас с его данными внесут в миграционную базу, и выехать можно будет только в РФ по тому же внутреннему паспорту. При попытке выехать в Турцию по загранпаспорту встанет вопрос, почему нет отметки о въезде, а в базу внесен другой документ, удостоверяющий Вашу личность.
Если уж и пытаться схитрить, если Вам это зачем-то нужно, то документ надо менять «между границами» — выехать из РФ по внутреннему паспорту, а въехать в Армению по заграничному, дальше им пользоваться, а потом наоборот. Но и тут могут быть проблемы все равно, если авиакомпании передают данные о документах пассажиров, по которым они сели в самолет.