Здравствуйте, Наталья!
Если штраф был выставлен необоснованно, можно обжаловать его. В вашей ситуации повестка с вызовом на 21 октября пришла позже штрафа, и ваш сын на нее явился, поэтому у военкомата отсутствуют основания для наказания.
Для обжалования штрафа нужно написать заявление на имя начальника военкомата, указав в нем даты получения штрафа и повестки, а также приложить копии документов, которые подтверждают эти даты (например, повестку или квитанцию с датой получения). Попросите пересмотреть штраф и его обоснованность. Если военкомат откажет или оставит ваше обращение без внимания, можно обратиться с жалобой в вышестоящий орган или прокуратуру, приложив копии всех документов и пояснив ситуацию.
Подобные ошибки, особенно в период массовых призывов, к сожалению, встречаются. Правомерное и официальное обжалование через письменное заявление и обращение в надзорные органы часто помогает решить такие вопросы.