Здравствуйте, Наталья.
Однозначно трудно ответить на Ваш вопрос. В данном случае все будет зависеть от решения конкретного судьи.
Согласно ст.196 ГК РФ
Общий срок исковой давности составляет три года со дня, определяемого в соответствии со статьей 200 настоящего Кодекса.
Согласно ст.200 ГК РФ
Если законом не установлено иное, течение срока исковой давности начинается со дня, когда лицо узнало или должно было узнать о нарушении своего права и о том, кто является надлежащим ответчиком по иску о защите этого права.
Мое мнение такое: поскольку до получения свидетельства о праве на наследство и до обращения в банк Вы не могли знать, что причитающиеся Вам деньги сняла супруга отца, то течение срока исковой давности начинается как минимум с даты получения свидетельства о праве на наследство.
Я полагаю, что в суд обращаться нужно в любом случае, поскольку срок исковой давности применяется судом только по заявлению стороны в споре, сделанному до вынесения решения (ст.199 ГК РФ).