Или сестра должна указать в доверенности что дети тоже дают согласие, и что для этого нужно, просто ей сказали что нужно в приехать в опеку по месту прописки

Добрый вечер, Айнагуль, г. Москва !

Сестра уехала в другой город, оставила дом мне, я хочу начать строительство нового дома, она написала на меня доверенность чтобы я могла делать все сама, но ее дети несовершеннолетние тоже собственники, что мне делать, мне нужно уведомить в администрации города что я начинаю стройку, мне нужно заявление от всех собеседников писать ?

Вы не собственник, смотря что написано в доверенности. Есть ли там полномочие нового строительства. При постройке нового дома ее дети тоже будут собственниками. Прежде нужно переход прав собственности. договоритесь о дарении. Получите разрешение от опеки на дарение долей детей.