И чего его лишают (зарплата ) или за штат выведут до решения суда?

В распоряжение (за штат) военнослужащий выводится до вынесения судом приговора по уголовному делу, о чем указано в ст. 13 Положения о порядке прохождения военной службы

2. Зачисление военнослужащего, проходящего военную службу по контракту, в распоряжение командира (начальника) допускается в следующих случаях и на следующие сроки:
в) в связи с возбуждением в отношении военнослужащего уголовного дела -до вынесения решения по уголовному делу;

В период нахождения его в распоряжении порядок выплаты ему денежного довольствия определяется ст. 2 ФЗ  от 07.11.2011 N 306-ФЗ «О денежном довольствии военнослужащих и предоставлении им отдельных выплат»

28. В период нахождения военнослужащего, проходящего военную службу по контракту, в распоряжении командира (начальника) ему выплачиваются оклад по воинскому званию, оклад по последней занимаемой воинской должности и ежемесячная надбавка за выслугу лет в порядке, предусмотренном руководителем федерального органа исполнительной власти или федерального государственного органа, в которых федеральным законом предусмотрена военная служба.

Таким образом, у него сокращается выплата денежного довольствия, за счет исключения из его состава ряда выплачиваемых надбавок.

В том случае, если военнослужащему избрана мера пресечения в виде заключения под стражу, то в силу ст. 2 ФЗ «О денежном довольствии военнослужащих и предоставлении им отдельных выплат» выплата ему довольствия приостанавливается. 

30. Военнослужащему, в отношении которого в качестве меры пресечения применено заключение под стражу, выплата денежного довольствия приостанавливается со дня заключения его под стражу и возобновляется со дня освобождения из-под стражи. 

До какого времени военнослужащим будет считаться когда находится в подозрению в хищении

 До прекращения уголовного дела или до момента предъявления ему обвинения.

Мера пресечения наблюдения командования части применялась?

Если да, то Вы подозреваемым можете быть не более 10 суток.

В силу ст. 100 УПК РФ

В исключительных случаях при наличии оснований, предусмотренных статьей 97 настоящего Кодекса, и с учетом обстоятельств, указанных в статье 99 настоящего Кодекса, мера пресечения может быть избрана в отношении подозреваемого. При этомобвинение должно быть предъявлено подозреваемомуне позднее 10 суток с момента применения меры пресечения

Если мера пресечения не выбиралась, то  в принципе срок не установлен

или за штат выведут до решения суда?

 Как видите, должны вывести… Если все таки не выведут, то платить должны полное денежное довольствие