Можно ли сделать нотариальную копию иностранного свидетельства о смерти для выписки из квартиры?

Можно (п. 4 Методических рекомендаций по свидетельствованию верности копий документов и выписок из них).

Здравствуйте, Людмила!

В Санкт — Петербурге в паспортный стол для выписки её из квартиры по смерти (форма 9) требуют отдать оригинал.

 такое требование формально законно:

31. Снятие гражданина с регистрационного учета по месту жительства производится органами регистрационного учета в случае:
д) смерти или объявления решением суда умершим — <...> на основании документа, выданного компетентным органом иностранного государства в удостоверение факта регистрации смерти...

Это не значит, что оригинал заберут, просто сверят копию с оригиналом и вернут заявителю. 

Можно ли заказать в России нотариально заверенную копию такого свидетельства о смерти?

 можно, но надо будет тоже предъявить оригинал, без его проверки копию не заверят. 

Что делать?

 попробовать предъявить нотариальную копию документа о смерти, если боитесь предъявить оригинал.

Можно было поступить иначе, если еще не прошел 1 месяц со дня регистрации смерти — обратиться в консульство РФ на территории страны, где умер гражданин РФ, для передаче сведений в электронный реестр ЗАГС. Потом, уже на основании сведений из этого реестра и заявления заинтересованного лица, снимать умершего с учета по месту жительства. 

Если у Вас еще остались вопросы, Вы можете задать их мне в рамках индивидуальной платной консультации в чате (стоимость и время консультации согласовываются там же).