Если я работаю по трудовому договору, то могу подать заявление на эмансипацию?

Да, можете. Заявление об эмансипации может подать несовершеннолетний, достигший 16 лет, если он работает по трудовому договору или занимается предпринимательской деятельностью и может полностью обеспечивать себя

Эмансипация производится по решению органов опеки. Для этого потребуется предоставить следующие документы:
свидетельство о рождении;
паспорт;
паспорта родителей или опекунов;
письменное согласие обоих родителей, усыновителей и пр.;
документы, подтверждающие  трудовую деятельность (трудовой договор, выписка из ЕГРИП, если несовершеннолетний зарегистрирован как ИП).

Здравствуйте, в Гражданском кодексе РФ говорится, что несовершеннолетний, достигший шестнадцати лет, может быть объявлен полностью дееспособным, если он работает по трудовому договору, в том числе по контракту, или с согласия родителей, усыновителей или попечителя, либо занимается предпринимательской деятельностью. 

Объявление несовершеннолетнего полностью дееспособным (эмансипация) производится по решению органа опеки и попечительства, с согласия обоих родителей, усыновителей или попечителя либо при отсутствии такого согласия — по решению суда.  

 Так что, да, вы имеет право на подачу заявления.