Случаи, когда ИФНС должна признать задолженность безнадежной, указаны в ст. 59 НК РФ:
В соответствии с подп. 4 п. 1 ст. 59 НК РФ Безнадежной к взысканию признается задолженность, числящаяся за налогоплательщиком, плательщиком сборов, плательщиком страховых взносов или налоговым агентом и повлекшая формирование отрицательного сальдо единого налогового счета такого лица, погашение и (или) взыскание которой оказались невозможными, в случае:
принятия судом акта, в соответствии с которым налоговый орган утрачивает возможность взыскания задолженности в связи с истечением установленного срока ее взыскания, в том числе вынесения им определения об отказе в восстановлении пропущенного срока подачи заявления в суд о взыскании задолженности.
Т.е. сам по себе факт наличия просрочки срока исковой давности по взысканию налоговой задолженности не является основанием для признания долга безнадежным и его исключению из единого налогового счета налогоплательщика, т.к. кредитор имеет право подать иск о взыскании долга и за пределами срока исковой давности.
Исковая давность согласно ст. 199 ГПК РФ применяется судом по заявлению стороны в споре, сделанном до момента вынесения решения.
Требование о защите нарушенного права принимается к рассмотрению судом независимо от истечения срока исковой давности.
В соответствии с п. 2 и 3 ст. 199 ГПК РФ:
2. Исковая давность применяется судом только по заявлению стороны в споре, сделанному до вынесения судом решения.
3. Истечение срока исковой давности, о применении которой заявлено стороной в споре, является основанием к вынесению судом решения об отказе в иске.
Чтобы исключить возможность списания Ваших платежей в счет погашения долгов прошлых периодов при оплате очередного платежа следует в назначении платежа обязательно указывать, за какой период оплачиваете налоговую задолженность.
При указании в п/п периода, за который Вы оплачиваете задолженность, данный платеж не может быть зачтен в счет погашения долгов прошлых периодов, а должен быть учтен за тот период, который указан в п/п в назначении платежа.