Добрый день, Татьяна.
Какие налоги уплачиваются?
Это зависит от того, сколько лет был собственником доли мажоритарный учредитель.
Если более пяти лет, то тогда налог не уплачивается, в том числе если выплатите ему долю недвижимостью, см. письмо Минфина России от 9 ноября 2018 г. N 03-04-06/80846 :
Согласно пункту 17.2 статьи 217 Кодекса освобождаются от налогообложения доходы, получаемые от реализации (погашения) долей участия в уставном капитале российских организаций, а также акций, указанных в пункте 2 статьи 284 Кодекса, при условии, что на дату реализации (погашения) таких акций(долей участия) они непрерывно принадлежали налогоплательщику на праве собственности или ином вещном праве более пяти лет.
Таким образом, при выходе участника из общества с выплатой ему действительной стоимости доли… доходы от такого отчуждения освобождаются от налогообложения при соблюдении условий, предусмотренных пунктом 17 статьи 217 Кодекса.
Согласно пункту 6.1 статьи 23 Федерального закона от 08.02.1998 N 14-Ф3 «Об обществах с ограниченной ответственностью» в случае выхода участника общества из общества в соответствии со статьёй 26 указанного Федерального закона его доля переходит к обществу. Общество обязано выплатить участнику общества, подавшему заявление о выходе из общества, действительную стоимость его доли в уставном капитале общества или с согласия этого участника общества выдать ему в натуре имущество такой же стоимости.
В целях применения положений пункта 17.2 статьи 217 Кодекса не имеет значения была ли выплачена участнику общества при его выходе из общества действительная стоимость доли в денежной форме или ему было выдано имущество такой же стоимости.
Если же меньше пяти лет, то НДФЛ с суммы дохода нужно исчислить по ставке 13 процентов (п. 3 ст. 214, п. 1 ст. 224 НК РФ). Если это Ваш случай, то также советую Вам ознакомиться с рекомендациями в тех случаях, когда стоимость выдаваемой взамен доли учредителя недвижимости равна, меньше или больше стоимости доли.
С уважением, Роман.
К сожалению, не занимаюсь налогами.
Подождите — кто-нибудь из коллег-налоговых специалистов дополнит.