Здравствуйте, Игорь.
Я являюсь налоговым резидентом РФ, но работаю на компанию Республика Армения. Нахожусь я на территории РФ.
Следовательно, доходы от армянской компании являются для Вас налогооблагаемыми в том числе и в РФ, исходя из ст.ст. 207-210 НК РФ, ст.14 Соглашения между Правительством РФ и Правительством Республики Армения от 28.12.1996 «Об устранении двойного налогообложения на доходы и имущество»
Вместе с тем, в соответствии с п.1 ст.22 Соглашения Вы вправе зачесть при определении своих налоговых обязанностей в РФ то, что уплатили в Армении, само собой не более того, что должно уплачиваться в РФ.
Зачет осуществляется в соответствии со ст.232 НК РФ, для этого в году следующем за годом получения дохода в Армении Вам следует подать налоговую декларацию и приложить документы, подтверждающие уплату налога в Армении.
Не вводите в заблуждение, п.3 ст.2 Соглашения упомянутых Вами положений не содержит.