Добрый день, недавно снимал квартиру на посуточно, без договора, но с залогом 1000 рублей, в ходе проживания

Здравствуйте. Поскольку у Вас договора нет, то хозяину придётся доказать, что ущерб нанесён именно Вами. А Вам, если хотите вернуть залог, что зало был. Хозяину придётся если что обращаться в суд. Ст. 1064 ГК РФ

1. Вред, причиненный личности или имуществу гражданина, а также вред, причиненный имуществу юридического лица, подлежит возмещению в полном объеме лицом, причинившим вред.

Придётся доказывать по сути всё.