Как исправить этот момент в реестре недвижимости?

Добрый день, Сергей!

Такая запись в ЕГРН вносится в соответствии с п. 4 ч. 3 ст. 9, ч. 5 ст. 38 Федерального закона от 13.07.2015 N 218-ФЗ «О государственной регистрации недвижимости». В настоящее время действующими нормативными правовыми актами не предусмотрена  возможность в административном порядке исключения из Единого государственного реестра недвижимостисведений о том, что государственная регистрация прав была осуществлена без необходимого в силу закона согласия третьего лица. Между тем, данная отметка не влечет никаких угроз для Вашей недвижимости с учетом того, что:

На момент сделки у неё было свидетельство о смерти супруга

Согласие от супруга необходимо удостоверить нотариально. Делается это для того, чтобы обезопасить продавца от расторжения сделки через суд, если муж (или жена) покупателя захочет оспорить договор купли-продажи и добиться возврата денег. Т.е. спустя время сделка может быть признана ничтожной. С этим понятно. На момент совершения сделки супруга продавца не было в живых. Это как раз настораживающий факт, так как для получения полных прав на объект недвижимости супруга лица должна была вступить в наследство в течение 6 месяцев. Если дом был продан до вступления в наследство, то сделка сама по себе является ничтожной. Здесь необходимо Вам уточнить тот момент. Бывает, что и спустя годы сделку отменяют. 

Нужно обращаться в росреестр и получать у них справку о том, какие необходимы им документы для ликвидации записи. В этом они могут отказать. Отправят в суд. Скорее всего именно через суд и придется решать эту проблему.