Здравствуйте, Дмитрий.
Если Вы считаете, что детям лучше проживать с Вами, то имеете право в судебном порядке определить место проживания детей с отцом (с Вами). При этом суд привлечёт к участию в деле органы опеки, которые будут исследовать условия Вашего места жительства и дадут свое заключение.
Согласно части 3 статьи 65 Семейного кодекса РФ:
При отсутствии соглашения спор между родителями разрешается судом исходя из интересов детей и с учетом мнения детей. При этом суд учитывает привязанность ребенка к каждому из родителей, братьям и сестрам, возраст ребенка, нравственные и иные личные качества родителей, отношения, существующие между каждым из родителей и ребенком, возможность создания ребенку условий для воспитания и развития (род деятельности, режим работы родителей, материальное и семейное положение родителей и другое).
По требованию родителей (одного из них) в порядке, установленном гражданским процессуальным законодательством, и с учетом требований абзаца второго настоящего пункта суд с обязательным участием органа опеки и попечительства вправе определить место жительства детей на период до вступления в законную силу судебного решения об определении их места жительства.
Да, через суд