В зависимости от формы обучения.
В соответствии со ст. 173 ТК РФ:
Работникам, направленным на обучение работодателем или поступившим самостоятельно на обучение по имеющим государственную аккредитацию программам бакалавриата, программам специалитета или программам магистратуры по заочной и очно-заочной формам обучения и успешно осваивающим эти программы, работодатель предоставляет дополнительные отпуска с сохранением среднего заработка для
Поэтому если Ваш сотрудник обучается на заочной или очно-заочной форме, то ему следует оплатить учебный отпуск.