Безусловно кафе обязано платить. И за потреблённые коммунальные услуги и за использование общедомового имущества.
Вопрос только в правовом статусе тех двух квартир.
В любом случае Вы можете написать заявление о перерасчёте квартплаты.
Кроме того можно написать заявление о фактах некорректного расчёта и начисления платы за пользование общедомовым имуществом/за помещение в государственную жилищную и прокуратуру.
Так же стоит узнать каковы правовые основания для установки рекламы на фасаде здания. И по нормам Жилищного кодекса и по нормам закона о рекламе, для установки рекламной конструкции требуется согласие собственников. Уполномачивало ли общее собрание собственников управляющую компанию заключать договора об использовании общедомовым имуществом?
Если нет, то опять-таки нарушение со стороны или кафе или управляющей компании (если было выдано разрешение на установку, хотя полномочий на выдачу такого документа не было). Об это так же можно написать в прокуратуру или в Федеральную антимонопольную службу.