Как сказали что оснований нет

Уволить Вас по собственному желанию вряд ли смогут поскольку в силу ст. 51 ФЗ «О воинской обязанности и военной службе»

как уже сказал принятия решения об увольнении — право, а не обязанность командования.

Как отмечено в законе

6. Военнослужащий, проходящий военную службу по контракту, по заключению аттестационной комиссии может быть уволен с военной службы досрочно по собственному желанию при наличии у него уважительных причин.

А с учетом данных разъяснений в постановление Пленума Верховного Суда РФ от 29.05.2014 N 8

«О практике применения судами законодательства о воинской обязанности, военной службе и статусе военнослужащих»

Поданный военнослужащим рапорт и соответствующее заключение аттестационной комиссии не являются безусловными основаниями для увольнения по собственному желанию, поскольку решение данного вопроса отнесено к полномочиям соответствующего воинского должностного лица.

Поэтому в данном случае нет смысла обжаловать указанный отказ в суде.

Можете попробовать уволиться во состоянию здоровья, если есть перспектива, что при наличии у Вас какого-то заболевания при прохождении ВВК определят категорию годности В.

Если этот вариант, вам не подходит, то в Вашем случае Вы можете уволиться в связи с осуществлением предпринимательской деятельности.

В той же ст. 51 Закона говориться, что 

1. Военнослужащий подлежит увольнению с военной службы:д.1) в связи с утратой доверия к военнослужащему со стороны должностного лица, имеющего право принимать решение о его увольнении, в случае:участия военнослужащего на платной основе в деятельности органа управления коммерческой организации, за исключением случаев, установленных федеральным законом;
осуществления военнослужащим предпринимательской деятельности;

И здесь, если Вы будете включены в число органов управления ООО (например, назначены на должность директора) с установлением Вам заработной платы — это будет являться безусловным основанием для увольнения.

Только вот нюанс по выплатам.

В силу ст. 3 ФЗ  от 07.11.2011 N 306-ФЗ «О денежном довольствии военнослужащих и предоставлении им отдельных выплат»

денежные выплаты при увольнении по указанному основанию не производятся.

3. Военнослужащему, проходящему военную службу по контракту, общая продолжительность военной службы которого составляет менее 20 лет, при увольнении с военной службы выплачивается единовременное пособие в размере двух окладов денежного содержания, а военнослужащему, общая продолжительность военной службы которого составляет 20 лет и более, выплачивается единовременное пособие в размере семи окладов денежного содержания.
4. Единовременное пособие, указанное в части 3 настоящей статьи, не выплачивается военнослужащему, проходящему военную службу по контракту, при увольнении его с военной службы:
13) в связи с утратой доверия к военнослужащему в случаях, предусмотренных подпунктами «д.1» и «д.2» пункта 1 статьи 51 Федерального закона от 28 марта 1998 года N 53-ФЗ «О воинской обязанности и военной службе»;

В этом случае решать конечно Вам.