Елена, добрый день.
Собственно наиболее негативное последствие здесь одно, это невозможность занимать руководящие должности для руководителя в течении 3х лет после ликвидации организации.
Согласно ст. 23 ФЗ «О государственной регистрации юридических лиц и ИП»:
ф) если в регистрирующий орган представлены документы для включения сведений об учредителе (участнике) юридического лица либо о лице, имеющем право без доверенности действовать от имени юридического лица, в отношении одного из следующих лиц:
являющихся лицами, имеющими право без доверенности действовать от имени юридического лица, в отношении которого в едином государственном реестре юридических лиц содержится запись о недостоверности сведений о юридическом лице, предусмотренных подпунктом «в» или «л» пункта 1 статьи 5 настоящего Федерального закона либо имеется неисполненное решение суда о ликвидации указанного юридического лица, за исключением случаев, когда запись о недостоверности сведений о юридическом лице, содержащихся в едином государственном реестре юридических лиц, внесена в единый государственный реестр юридических лиц в порядке, предусмотренном пунктом 5 статьи 11 настоящего Федерального закона, или когда на момент представления документов в регистрирующий орган истекли три года с момента внесения соответствующей записи в единый государственный реестр юридических лиц;
Таким образом при принудительной ликвидации в случае регистрации нового ООО в течении 3х лет Вам будет отказано, если Вы являетесь лицом имеющим право действовать без доверенности.
Оспорить можно в порядке гл. 24 АПК РФ устанавливающей порядок обжалования ненормативных правовых актов, решений и действия/бездействия государственных органов.
Предварительно следует подать жалобу в вышестоящий налоговый орган.
По основаниям для подачи уже надо смотреть и более детально разбирать ситуации и есть ли такие основания вообще.
Так же возможно привлечение к административной ответственности согласно ст. 14.25 КоАП РФ:
Сведения сохраняются длительное время, срок хранения сведений в электронном ЕГРЮЛ законодательно не установлен, там содержаться сведения о всех когда либо зарегистрированных и ликвидированных юридических лицах с указанием оснований.