Загородный дом оформлен как квартира

тогда мой ответ в силе 

как правило разделяют для удобства — если квартира, а не 1/2, то не надо согласия на продажу от второго собственника, уголь отдельно, довольно прочно сложившаяся практика на сегодняшний день, да и фактически такое помещение именно отдельная квартира.

По ЕГРН  — квартира, жилое помещение.

ВРИ земли - ЛПХ (категория земли — земли населенных пунктов)

Дом разделен на две части по решению суда.

Считаю, что особых изменений в уже данной консультации указанные сведения не вносят. Хоть это будет квартира, хоть половина дома, хоть и дом блокированной застройки учитывая, что между указанными половинами нет несущих стен в любом случае подход один — получение согласия соседа на реконструкцию, согласование проекта реконструкции в муниципалитете и последующие работы по реконструкции.

Почему дом был зарегистрирован как квартира при разделении? Может ли в этом быть подвох при покупке или последующей продаже?

Тут довольно трудно сказать о причинах. Я думаю, что возможно была какая-то ошибка при регистрации двух новых объектов взамен одного ранее существовавшего. Другое дело, что с точки зрения реконструкции каких-то особенностей тут нет. Разве что Вы захотите полностью разделить эти две части таким образом, чтобы они были совершенно автономными. Если говорить о возможной будущей продаже, то может быть кому-то интересно приобретать этот объект именно как часть дома (сблокированный дом), а кому-то как квартиру. 

При этом стоит обратить внимание также и на земельный участок, который в случае, если это квартира и дом признан многоквартирным, то согласно  ч. 1 ст. 36 Жилищного кодекса РФ собственникам помещений в многоквартирном доме земельный участок, на котором расположен данный дом, с элементами озеленения и благоустройства принадлежат на праве общей долевой собственности.Поэтому тут могут быть определенные сложности, правда не всегда. А вот в случае, если это часть дома или дом блокированной застройки, то земельный участок может быть без проблем выделен отдельно каждому собственнику.

ЛПХ. Для ведения личного подсобного хозяйства (приусадебный земельный участок) Размещение жилого дома, указанного в описании вида разрешенного использования с кодом 2.1;

Размещение жилого дома (отдельно стоящего здания количеством надземных этажей не более чем три, высотой не более двадцати метров, которое состоит из комнат и помещений вспомогательного использования, предназначенных для удовлетворения гражданами бытовых и иных нужд, связанных с их проживанием в таком здании, не предназначенного для раздела на самостоятельные объекты недвижимости);

СП 55.13330.2016 Дома жилые одноквартирные. 

1.1 Настоящий свод правил распространяется на проектирование, строительство, реконструкцию жилых одноквартирных домов (далее — дома) с количеством наземных этажей не более чем три, отдельно стоящих или блокированной застройки.

3.3 блокированная застройка домами жилыми одноквартирными: Застройка, включающая в себя два и более пристроенных друг к другу дома, каждый из которых имеет непосредственный выход на отдельный приквартирный участок.

По моему мнению (не видя решения суда о разделе дома) суд из ИЖС превратил в дом блокированной застройки…

Чтобы не было проблем вид разрешенного использования ЛПХ необходимо изменить на блокированную застройку по факту (решению суда).

.Подтверждение соответствия объекта признакам жилого дома блокированной застройки в данном случае должно быть отражено в заключении органа местного самоуправления. Копия такого заключения включается в приложение к техническим планам.

А после получить разрешение на реконструкцию свой части без согласия второй половины..

Определение СК по гражданским делам Верховного Суда РФ от 26 апреля 2016 г. N 56-КГ16-1 Суд направил дело о приведении переустроенного жилого помещения в прежнее состояние на новое рассмотрение, поскольку ответчик получил от администрации района разрешение на реконструкцию принадлежащей ему части жилого дома; кроме того, по результатам технической экспертизы строительные работы выполнены с соблюдением строительно-технических норм, признаки наличия угрозы жизни и здоровью граждан вследствие разрушения конструкций второго этажа отсутствуют

Спор возник между двумя собственниками отдельных жилых помещений в доме.

Один из них провел реконструкцию своей части дома, разобрав крышу и возведя второй этаж.

Второй собственник обратился в суд, потребовав обязать ответчика привести переустроенное жилое помещение в прежнее состояние.

Согласно доводам истца он не давал согласия на переустройство.

Данное переустройство нарушает его жилищные права, поскольку дом стоит на едином фундаменте. В результате постройки второго этажа на фасаде образовалась трещина.

Суды двух инстанций поддержали позицию истца.

СК по гражданским делам ВС РФ отправила дело на новое рассмотрение и пояснила следующее.

В данном случае надо было выяснить статус дома, в котором расположены помещения сторон.

От этого зависело правильное разрешение судом вопроса о необходимости получения согласия истца на произведенную ответчиком реконструкцию.

ЖК РФ определены виды жилых помещений, имеющих отношение к понятию «многоквартирный дом». Основной критерий отнесения дома к многоквартирному — совокупность нескольких квартир, имеющих самостоятельные выходы в помещения общего пользования, а также наличие элементов общего имущества.

Так, в данном деле помещения общего пользования в жилом доме отсутствовали. Каждая из его частей располагалась на отдельном участке с самостоятельным кадастровым номером.

Исходя из ГрК РФ, жилые дома блокированной застройки не относятся к многоквартирным.

Да, еще необходимо осмотреть ПЗЗ для Вашей тер. зоны, можно ли в ней строить дома блок. застройки. Если можно то проблем не будет по изменению ВРИ.