Здравствуйте.
Договор Вашей организации переоформлять нет необходимости.
Пунктом 1 ст.58 ГК РФ установлено, что при слиянии организаций все права и обязанности каждой переходят к вновь возникшему юридическому лицу в порядке универсального правопреемства вне зависимости от составления передаточного акта и его содержания. Факт правопреемства подтверждается сведениями из ЕГРЮЛ о реорганизации юридического лица, созданного в результате слияния и документами организации прекратившей деятельность в результате слияния, определяющими соответствующие права и обязанности, в отношении которых наступило правопреемство.
Соответственно сказанному по договору на капитальное строительство, заключенному прекратившей свою деятельность, организацией, все права и обязанности перешли к вновь созданному юридическому лицу в результате универсального правопреемства.
Универсальное правопреемство -
переход прав и обязанностей в неизменном виде как единого целого к одному или нескольким правопреемникам. Правопреемник приобретает все имущество в совокупности, включая даже те права и обязанности, о существовании которых не знал или которые возникнут в будущем.
правопреемник замещает правопредшественника во всех правоотношениях, в которых участвовал последний, за исключением тех, которые носят строго личный характер.
правопреемство совершается в один и тот же момент. Это значит, что весь комплекс прав и обязанностей правопредшественника переходит к правопреемнику одновременно, что не предполагает, например, принять одни права раньше, а другие – позже).