Татьяна,
Изменение фамилии ребенком по достижении им 14-летнего возраста регулируется Федеральным законом от 15.11.1997 г. № 143-ФЗ
(ред. от 07.05.2013)
«Об актах гражданского состояния».
В соответствии со ст. 58 данного закона
Лицо, достигшее возраста четырнадцати лет, вправе переменить свое имя, включающее в себя фамилию, собственно имя и (или) отчество. Перемена имени производится органом записи актов гражданского состояния по месту жительства или по месту государственной регистрации рождения лица, желающего переменить фамилию, собственно имя и (или) отчество. Перемена имени лицом, не достигшим совершеннолетия, производится при наличии согласия обоих родителей, усыновителей или попечителя, а при отсутствии такого согласия на основании решения суда, за исключением случаев приобретения лицом полной дееспособности до достижения им совершеннолетия в порядке, предусмотренном законом.
Таким образом, при отсутствии согласия отца фамилию Вашей дочери можно будет поменять через суд (в суде необходимо будет доказать, что невозможно получить согласие отца, поскольку неизвестно его местонахождение. Также по достижении совершеннолетия Ваша дочь может сделать это самостоятельно, в этом случае согласия родителей уже не будет требоваться.