Добрыц вечер! На мой взгляд, у Вас есть 2 варианта действий:
1 вариант. Предполагаю, что у Вас закупка с одним этапом исполнения, следовательно поставить товар Вам должны одновременно в полном объеме. Оплата производитмя в течение 10 рабочих дней с момента предоставления счета или счета-фактуры и подписания накладной. Так как товар поставлен не в полном объеме, накладную подписать Вы не можете. Таким образом, у поставщика образуется просрочка исполнения, за каждый день просрочки начисляется пеня. После полной поставки (в ноябре) подписываете накладную и оплачиваете без каких-либо просрочке со своей стороны, а поставщик в свою очередь выплачивает пени.
2 вариант.оплачиваете фактически поставленный товар, после чего подписываете соглашение о расторжении контракта в части неисполненных обязательств с указанием причин расторжения. В еис в документах размещаете информацию и об исполнении контракта (прикрепляет накладную и платежное поручение) и о расторжении контракта с прикреплением подписанного соглашения.
не могли бы вы подсказать статью из 44 фз, который расписывает действие 2 варианта?
и еще вопрос, после того как мы расторгнем контракт, мы должны внести информацию о поставщике в РНП?
В случае частичной приемки товара не обязательно расторгать контракт. Вы можете направить ему требование об уплате неустойки и после полной поставки товара взыскать с него пени за просрочку недопоставленного в срок товара.